TUhjnbcbe - 2021/6/3 19:16:00
大家好，我是濤濤。开春第一篇用工具复现的生信文章，我们就来一起用“鼠标”开启“牛气”之路，无代码复现一篇年月发表在Frontiersinoncology的一篇4.8分的文章。瞧，迎面向我们走来的是“单基因泛癌免疫分析”的文章！（藏镜人：这是在开运动会吗？这是什么方阵，怎么我从来没有见过，不明觉厉啊！）（濤濤酱：哈哈，没错！如果把我们生信比作是一场运动会开幕式的话，那么首屈一指的必定是引领时代潮流的“单基因泛癌分析”了！）单基因泛癌分析，顾名思义，就是一个基因在多种肿瘤中的分析。大家应该都有看过古装剧吧？拿到“免死金牌”的那个勇士，可以独闯一切皇宫内的门禁。“单基因泛癌分析”也是一样道理。只要你找到了这个特别的基因，也即拿到了这块“免死金牌”，你就能自如穿梭于各个肿瘤，在里面恣意驰骋，生出一篇又一篇的高分生信文章！（藏镜人：这！么！好！啥也别说了，快来教教如何单基因泛癌分析！）（濤濤酱：擒贼先擒王，要想做出一篇“单基因泛癌分析”的文章，里面林林种种的生信手段你总得先学会吧？）（藏镜人：蛤？那不就又得花上一年半载的吗……）（濤濤酱：嘿嘿，这时候就得隆重推出我们的仙桃生信工具了！不用代码，不用R语言，只要鼠标！只要鼠标！泛癌分析带回家！）闲话少叙，我们一起来看一下我们今天的文章题目：PrognosticandImmunologicalRoleofFUN4DomainContaininginPan-Cancer:FriendorFoe?FUN4DomainContaining，简称为FUNDC。这个基因在线粒体自噬里面起到了重要作用。作者在这篇文章中，通过探讨FUNDC在泛癌的预后以及免疫浸润情况从而论证了FUNDC基因在肿瘤中的作用。在“材料和方法”部分，作者开宗明义地阐明了本文实现的生信手段。复现任务▲图.FUNDC在泛癌中的表达模式▲图2.Kaplan-Meier生存曲线比较了PrognoScan中不同癌症类型中FUNDC的高表达和低表达▲图3.Kaplan-Meier生存曲线比较了Kaplan-Meierplotter中不同类型癌症中FUNDC的高表达和低表达▲图4.具有不同临床病理特征的肝细胞癌中FUNDCmRNA表达与OS和PFS的相关性▲图5.LIHC和LUSC中FUNDC表达与免疫浸润水平的相关性▲图6.FUNDC表达与LIHC和LUSC中的B细胞浸润和巨噬细胞极化相关▲表.FUNDC与TIMER免疫细胞基因标记之间的相关性▲表2.FUNDC与GEPIA中B细胞，巨噬细胞和单核细胞的基因标志物之间的相关性复现工具◆仙桃学术工具（