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TUhjnbcbe - 2021/5/20 17:53:00
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前段时间,华中科技大学郭安源教授生物信息学实验室发表了题为“hTFtarget:AComprehensiveDatabaseforRegulationsofHumanTranscriptionFactorsandTheirTargets”的研究论文。今天小编就为大家简单介绍一下这个人类转录因子靶基因的数据库。

要点介绍

研究问题:

人类转录因子靶基因的鉴定及其数据库的构建和应用

研究方法:

整合大规模的人类转录因子靶基因数据,综合考虑转录因子结合位点及基因组表观修饰状态对转录因子结合的影响,采用统一预测方法预测了相对可靠的人类转录因子靶基因,并构建了开源的人类转录因子靶基因数据库,同时分析了转录因子的细胞系特异性调控、转录因子间的协作调控等。

主要成果1:

建立了可靠的转录因子分析靶基因预测流程

主要成果2:

分析了个转录因子的多个ChIP-seq数据集,鉴定其靶基因,构建了hTFtarget人类转录因子靶基因数据库

主要成果3:

通过对示例转录因子的靶基因预测,展示了hTFtarget的主要应用

数据库链接:

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