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TUhjnbcbe - 2021/5/20 17:51:00

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菠萝基因组数据库结构

菠萝是单子叶植物,在进化上与禾本科植物近缘(包括玉米、高粱、水稻、小麦),是禾本科作物比较基因组分析最好的基因组,也是研究凤梨科和景天酸代谢光合作用植物很好的参考模型。

近日,由福建农林大学基因组中心张积森教授、硕士生徐慧敏开发的菠萝基因组数据库(PGD)正式上线。该数据库涵盖了基因功能注释、分子标记、比较基因组、基因表达量和基因共表达的搜索工具,还包括基因组可视化工具和在线序列比对工具,为菠萝基因组序列信息搭建了良好的平台。本数据库的目标为:存储和管理菠萝生物数据,促进禾本科作物比较基因组分析,进而构建综合型菠萝基因组数据库。

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