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TUhjnbcbe - 2020/12/30 13:23:00
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大家好!今天跟大家分享的是年5月发表在Aging(IF=4.)上的文章。文章利用了GEPIA数据库中的卵巢癌(OV)表达谱数据进行了溶质载体(SLC)家族蛋白表达分析,通过KM生存曲线分析、WGCNA分析以及基因富集分析筛选出了SLC7A2作为预后指标,通过GEO数据集和临床收集的OV样本进行了验证,后续利用卵巢癌细胞系进行了功能分析,说明这些SLC家族成员,尤其是SLC7A2具有成为OV诊断和治疗的新型生物标记物的潜力。

题目:SLC7A2servesasapotentialbiomarkerandtherapeutictargetforovariancancer

SLC7A2可作为卵巢癌的潜在生物标志物和治疗靶标

摘要

溶质载体(SLC)家族蛋白是最大的膜转运蛋白,但其在卵巢癌(OV)中的功能尚不清楚。本文分析了OV中具有氨基酸转运功能的SLC蛋白家族成员。在基因表达谱交互式分析和Kaplan-Meier绘图仪数据库中分析了OVS中SLC的mRNA表达水平和预后价值。选择显示差异表达和最显著的预后价值的SLC7A2用于进一步分析。使用cBioPortal数据库、基因组富集分析和WGCNA分析来探讨SLC7A2的潜在功能和分子机制。后续用临床样本和GEO数据集进行了验证,并在OV细胞系中进行了SLC7A2功能验证。总共对73名SLC家庭蛋白进行了分析,在OV中有7个上调表达,而有11个下调表达,其中15个是预后保护因子,而12个是预后危险因素。SLC7A2在OV中显著下调表达,并且与预后成正相关。功能验证结果表明抑制SLC7A2促进了OV细胞的活力,侵袭和迁移。综上所述,这些SLC家族成员,尤其是SLC7A2具有成为OV诊断和治疗的新型生物标记物的潜力。

流程图

1.数据的获取和整理

在GEPIA数据库(

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