白癜风治疗得多少钱 http://pf.39.net/bdfyy/bdflx/191121/7628437.html最近，看到Front.Genet.发了一篇文章IntAssoPlot:AnRPackageforIntegratedVisualizationofGenome-WideAssociationStudyResultsWithGeneStructureandLinkageDisequilibriumMatrix，主要推出了一个R包IntAssoPlot，该包整合了LocusZoom图、连锁不平衡图（LD）和基因结构信息。
往常画LocusZoom图和连锁不平衡图（LD）时需要提取相同的起始、终止位置，再分别用LocusZoom网站和haploview软件画。步骤多，画起来麻烦，关键画完以后还需要将他们拼在一起（看起来就不是很专业）。
IntAssoPlot包的优点是直接一步出图。
下载、安装很简单：
install.packages(c("ggplot2","ggrepel","reshape2"))if(!requireNamespace("BiocManager",quietly=TRUE))install.packages("BiocManager")BiocManager::install(c("SNPRelate","gdsfmt"))library(remotes)#version2.1.0#install_github("whweve/IntAssoPlot")install_github("whweve/IntAssoPlot",build=TRUE,build_vignettes=TRUE)
下面是IntAssoPlot包的示例数据展示：
library("IntAssoPlot")example("IntGenicPlot")example("IntRegionalPlot")画出来的基因结构、LD图、关联图如下所示：LD图和LocusZoom图：
下面是这个包的代码参数使用，作者很贴心的写好了：
以下是上面代码画出来的效果图：
有需求、有想法就可以成就一个包、一篇文献。
参考文献：
HeF,DingS,WangH,etal.IntAssoPlot:AnRPackageforIntegratedVisualizationofGenome-WideAssociationStudyResultsWithGeneStructureandLinkageDisequilibriumMatrix[J].FrontiersinGenetics,,11:.陈文燕
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