白癜风早期有什么症状 http://m.39.net/pf/a_7208874.html评估一个基因位点是否为患者的致病基因，游侠认为需要从三个方面来考虑，第一是临床评估，即该基因在数据库（如OMIM）中记录的表型是否与患者的表型想符合，第二是生物信息学评估，包括正常人群频率、突变类型、软件预测、序列保守性等等，第三是遗传模式评估，即如果是隐性遗传是否为父母（父母正常）分别携带一个位点，如果是显性遗传是否为新发突变（父母正常）。
对于人群频率来说，根据ACMG致病性指南：allelefrequencygreaterthanexpectedfordisorder是一个强良性证据，很多时候因为不知道疾病的患病率很难去设定cutoff，将来也许可以通过完善的数据库对不同的基因设置不同的cutoff，目前还难以实现，对于全外显子或全基因组测序设置一个统一的cutoff比较实用，之前游侠曾写过一篇文章《单基因遗传病的致病位点人群频率筛选阈值多少为好》，在这篇文章里建议cutoff设为万分之一，但是在后来的实际工作中发现这个cutoff过于严谨，容易把真阳性位点排除，纸上得来终觉浅，趁五一有时间还是老老实实来统计一下ClinVar数据库中已报道的致病位点在人群中的频率分布吧！
首先我们从ClinVar
